Class ChemCompAtom

java.lang.Object
org.biojava.nbio.structure.chem.ChemCompAtom
All Implemented Interfaces:
Serializable, CifBean

public class ChemCompAtom extends Object implements CifBean
Properties of an atom of a chemical component.
Since:
6.0.0
Author:
Sebastian Bittrich
See Also:
  • Constructor Details

    • ChemCompAtom

      public ChemCompAtom()
  • Method Details

    • getCompId

      public String getCompId()
    • setCompId

      public void setCompId(String compId)
    • getAtomId

      public String getAtomId()
    • setAtomId

      public void setAtomId(String atomId)
    • getAltAtomId

      public String getAltAtomId()
    • setAltAtomId

      public void setAltAtomId(String altAtomId)
    • getTypeSymbol

      public String getTypeSymbol()
    • setTypeSymbol

      public void setTypeSymbol(String typeSymbol)
    • getCharge

      public int getCharge()
    • setCharge

      public void setCharge(int charge)
    • getPdbxAlign

      public int getPdbxAlign()
    • setPdbxAlign

      public void setPdbxAlign(int pdbxAlign)
    • getPdbxAromaticFlag

      public String getPdbxAromaticFlag()
    • setPdbxAromaticFlag

      public void setPdbxAromaticFlag(String pdbxAromaticFlag)
    • getPdbxLeavingAtomFlag

      public String getPdbxLeavingAtomFlag()
    • setPdbxLeavingAtomFlag

      public void setPdbxLeavingAtomFlag(String pdbxLeavingAtomFlag)
    • getPdbxStereoConfig

      public String getPdbxStereoConfig()
    • setPdbxStereoConfig

      public void setPdbxStereoConfig(String pdbxStereoConfig)
    • getModelCartnX

      public double getModelCartnX()
    • setModelCartnX

      public void setModelCartnX(double modelCartnX)
    • getModelCartnY

      public double getModelCartnY()
    • setModelCartnY

      public void setModelCartnY(double modelCartnY)
    • getModelCartnZ

      public double getModelCartnZ()
    • setModelCartnZ

      public void setModelCartnZ(double modelCartnZ)
    • getPdbxModelCartnXIdeal

      public double getPdbxModelCartnXIdeal()
    • setPdbxModelCartnXIdeal

      public void setPdbxModelCartnXIdeal(double pdbxModelCartnXIdeal)
    • getPdbxModelCartnYIdeal

      public double getPdbxModelCartnYIdeal()
    • setPdbxModelCartnYIdeal

      public void setPdbxModelCartnYIdeal(double pdbxModelCartnYIdeal)
    • getPdbxModelCartnZIdeal

      public double getPdbxModelCartnZIdeal()
    • setPdbxModelCartnZIdeal

      public void setPdbxModelCartnZIdeal(double pdbxModelCartnZIdeal)
    • getPdbxComponentCompId

      public String getPdbxComponentCompId()
    • setPdbxComponentCompId

      public void setPdbxComponentCompId(String pdbxComponentCompId)
    • getPdbxResidueNumbering

      public String getPdbxResidueNumbering()
    • setPdbxResidueNumbering

      public void setPdbxResidueNumbering(String pdbxResidueNumbering)
    • getPdbxComponentAtomId

      public String getPdbxComponentAtomId()
    • setPdbxComponentAtomId

      public void setPdbxComponentAtomId(String pdbxComponentAtomId)
    • getPdbxPolymerType

      public String getPdbxPolymerType()
    • setPdbxPolymerType

      public void setPdbxPolymerType(String pdbxPolymerType)
    • getPdbxRefId

      public String getPdbxRefId()
    • setPdbxRefId

      public void setPdbxRefId(String pdbxRefId)
    • getPdbxComponentId

      public String getPdbxComponentId()
    • setPdbxComponentId

      public void setPdbxComponentId(String pdbxComponentId)
    • getPdbxOrdinal

      public int getPdbxOrdinal()
    • setPdbxOrdinal

      public void setPdbxOrdinal(int pdbxOrdinal)